Keisuke OBASE Ph.D.

Senior researcher
Laboratory of Microbial Ecology
Department of Mushroom Science and Forest Microbiology
Forestry and Forest Products Research Institute (FFPRI)
Matsunosato 1, Tsukuba, Ibaraki, 305-8687, JAPAN

e-mail:  obasek(at)affrc.go.jp
Research keywords:  Cenococcum, Coast, Community, Cryptic species, Ectomycorrhiza, Ericoid mycorrhiza, Fungi, Phylogeny  

 

Curriculum Vitae

Education:

Dissertation " Studies on dynamics of vegetation recovery and mycorrhizal associations on a denuded area formed by thick volcanic deposition of the 2000 eruption on Mt. Usu, Hokkaido, Japan."

Work experiences:

 

Publications

  1. Obase K, Tamai Y, Miyamoto T, Yajima T (2005) Macrofungal flora on the volcano Usu, deforested by 2000 eruptions. Eurasian journal of Forest Research 8:65-70
  2. Obase K, Kobayashi T, Miyamoto T, Tamai Y, Yajima T (2006) Inocybe nitidiuscula , new to Japan. Mycoscience 47:293-297
  3. Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T (2007) Mycorrhizal associations in woody plant species at the Mt. Usu volcano, Japan. Mycorrhiza 17:209-215
  4. Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T (2007) Morphological characteristics of ectomycorrhizas found in willow seedlings established in the area devastated by the volcanic eruption of Mt. Usu, Hokkaido, Japan in 2000. Eurasian journal of Forest Research 10:179-184
  5. Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T (2008) Mycorrhizal colonization status of plant species established in an exposed area following the 2000 eruption of Mt. Usu, Hokkaido, Japan. Landscape and Ecological Engineering 4:57-61
  6. Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T (2009) Mycorrhizal synthesis of four ectomycorrhizal fungi in potted Populus maximowiczii seedlings. Mycoscience 50:143-145
  7. Obase K, Cha JY, Lee JK, Lee SY, Lee JH, Chun KW (2009) Ectomycorrhizal fungal communities associated with Pinus thunbergii in the eastern coastal pine forests of Korea. Mycorrhiza 20:39-49
  8. 小長谷啓介 (2009) 2000年有珠山噴出物堆積地における植生再生初期動態と菌根共生に関する研究．北海道大学演習林研究報告66:1-31
  9. Obase K, Cha JY, Lee JK, Lee SY, Lee JH, Chun KW (2010) Investigations of ectomycorrhizal fungal colonization in Pinus thunbergii seedlings at a plantation area in Gangneung, using morphotyping and sequencing the rDNA internal transcribed spacer region. Journal of Korean Forest Society 99:172-178
  10. Obase K, Lee JK, Lee SK, Lee SY, Chun KW (2010) Variation of sodium chloride resistance in Cenococcum geophilum and Suillus granulatus isolates in liquid culture. Mycobiology 38:225-228
  11. Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW (2011) Enzyme activity of Cenococcum geophilum isolates on enzyme-specific solid media. Mycobiology 39:125-128
  12. Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW (2011) Regeneration of ectomycorrhizal fungal isolates following deep freeze storage. Mycobiology 39:133-136
  13. Fukuchi S, Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T (2011) Vegetation and colonization status of mycorrhizal and endophytic fungi in plant species on acidic barren at crater basin of volcano Esan in Hokkaido, Japan. Eurasian Journal of Forest Research 14:1-11
  14. Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW (2011) Diversity and community structure of ectomycorrhizal fungi in Pinus thunbergii forests in the eastern region of Korea. Mycoscience 52:383-391
  15. Obase K, Cha JY, Lee JK, Lee SY, Chun KW (2012) Ectomycorrhizal fungal community associated with naturally regenerating Pinus densiflora Sieb. et Zucc. seedlings on exposed granite slopes along woodland paths. Journal of Forest Research 17:388-392
  16. Obase K, Matsuda Y, Ito S (2013) Enkianthus campanulatus (Ericaceae) is commonly associated with arbuscular mycorrhizal fungi. Mycorrhiza 23:199-208
  17. Obase K, Matsuda Y (2014) Culturable fungal endophytes in roots of Enkianthus campanulatus (Ericaceae). Mycorrhiza 24:635-644
  18. Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME (2014) Culturable fungal assemblages growing within Cenococcum sclerotia in forest soils. FEMS Microbiology Ecology 90:708-717
  19. Smith ME, Amses KR, Elliott TF, Obase K, Aime MC, Henkel TW (2015) New sequestrate fungi from guyana: Jimtrappea guyanensis gen. sp. nov., Castellanea pakaraimophila gen. sp. nov, and Costatisporus cyanescens gen. sp. nov. (Boletaceae, Boletales). IMA fungus 6:297-317
  20. Henkel TW, Obase K, Husbands D, Uehling JK, Bonito G, Aime MC, Smith ME (2016) New Boletaceae taxa from Guyana: Binderoboletus segoi gen. and sp. nov., Guyanaporus albipodus gen. and sp. nov., Singerocomus rubriflavus gen. and sp. nov., and a new combination for Xerocomus inundabilis. Mycologia 108:157-173
  21. Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME (2016) Cladophialophora floridana and Cladophialophora tortuosa, new species isolated from sclerotia of Cenococcum geophilum in forest soils of Florida, USA. Mycoscience 57:26-34
  22. Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME (2016) Revisiting phylogenetic diversity and cryptic species of Cenococcum geophilum. Mycorrhiza 26:529-540
  23. 小長谷啓介 (2016) 外生菌根菌Cenococcum geophilumの系統学的多様性と隠蔽種について. 日本菌学会報57:23-30
  24. Uesugi T, Nakano M, Selosse MA, Obase K, Matsuda Y (2016) Pyrola japonica, a partially mycoheterotrophic Ericaceae, has mycorrhizal preference for russulacean fungi in central Japan. Mycorrhiza 26:819-829

International conference

（Oral presentation）

  1. ○Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T. Mycorrhizal association on denuded area at volcano Usu, Hokkaido, Japan. China-Japan Pan Asia Pacific Mycology Forum, Changchun (China), August 2008.
  2. ○Obase K. Mycorrhizal association on devastated areas at volcano Usu, Hokkaido, Japan. The Current Forest Issues and Studies Based on Climatic Change in Several Countries. Chuncheon (Republic of Korea), October 2008. 【Invited speaker】
  3. ○Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW. Diversity and community structure of ectomycorrhizal fungi in Pinus thunbergii coastal forests and their similarities between mature trees and regenerating seedlings. The First International Symposium of China-Japan-Korea Sister University -Recent Advances in Forest and Forest Products-. Chuncheon (Republic of Korea), August 2010. 【Invited speaker】
  4. ○Obase K. The diversity of ectomycorrhizal fungi -Recent approaches and problems -. MSJ(The Mycological Society of Japan)/KSM (Korean Society of Mycology) Joint Symposium. Osaka (Japan), September 2010. 【Invited speaker】
  5. ○Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW. Diversity of ectomycorrhizal fungi in Pinus thunbergii coastal forests on the eastern coast of Korea. 2011 International Forest Biodiversity Symposium. Chuncheon (Republic of Korea), February 2011. 【Invited speaker】

（Poster presentation）

  1. ○Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T. Ectomycorrhizal fungal flora on the volcano Usu, deforested by 2000 eruptions. 日米菌学合同大会, Hawaii (USA), July-August 2005.
  2. ○Obase K , Adikari Y, Yajima T, Tamai Y, Miyamoto T. Primary vegetation recovery after the 2000 eruption on the volcano Usu, Hokkaido, Japan. International Conference on Ecological Restoration in East Asia Osaka. Osaka (Japan), June 2006.
  3. ○Obase K, Tamai Y, Miyamoto T, Yajima T. Sporocarps occurrence after the 2000 eruption on the volcano Usu, Hokkaido, Japan. 5th International Conference on Mycorrhiza, Granada (Spain), June 2006.
  4. ○Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T. Ectomycorrhizal fungal flora on exposed area at volcano Usu, Hokkaido, Japan and effects of their inoculation on growth of willow seedlings on volcanic ash in pot experiment. International Symposium on Sustainable Development in East Asia, Beijing (China), March 2007.
  5. ○Obase K, Tamai Y, Yajima T. Macrofungal flora on the exposed area of volcano Usu, Hokkaido, Japan. Asian Mycology Congress (AMC 2007) and Xth International Marine and Freshwater Mycology Symposium (IMFMS), Penang (Malaysia), December 2007.
  6. ○Obase K, Cha JY, Lee JK, Lee SY, Lee JH, Chun KW. Ectomycorrhizal fungal community of Pinus thunbergii in a coastal pine forest and a plantation in east coast of Korea. 6th International Conference on Mycorrhiza, Belo Horizonte (Brazil), August 2009.
  7. ○Kim K, Obase K, Lee SY, Chun KW, Lee JK. Effects of benomyl and wood vinegar from Quercus species on ectomycorrhizal formation on red pine seedlings. XXIII IUFRO World Congress, Seoul (Republic of Korea), August, 2010
  8. ○Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW. Variation in enzyme activity of Cenococcum geophilum isolates on enzyme specific solid media. MSJ (The Mycological Society of Japan)/KSM (Korean Society of Mycology) Joint Symposium. Osaka (Japan), September 2010.
  9. ○Obase K, Lee JK, Lee SY, Chun KW. Diversity of ectomycorrhizal fungi in Pinus thunbergii coastal forests at an eastern coast of Korea. MSJ (The Mycological Society of Japan)/KSM (Korean Society of Mycology) Joint Symposium. Osaka (Japan), September 2010.
  10. ○Matsuda Y, Obase K, Kimura Y, Takeuchi Y, Ito S. Dominance of an ectomycorrhizal fungus Cenococcum geophilum in coastal Japanese black pine forests in Japan. Asian Mycological Congress. Incheon (Republic of Korea), August 2011.
  11. ○Obase K, Matsuda Y. Mycorrhizal status of Enkianthus campanulatus (Ericaceae). 7th International Conference on Mycorrhiza (ICOM7). New Delhi (India), Jan 2013.
  12. ○Matsuda Y, Takeuchi K, Obase K, Ito S. Genetic diversity and population structure of Cenococcum geophilum at coastal pine forests in Japan. 7th International Conference on Mycorrhiza (ICOM7). New Delhi (India), Jan 2013.
  13. ○Uesugi T, Nakano M, Obase K, Ito S, Matsuda Y. Polyphyletic members of Russula are dominant mycorrhizal fungi in roots of a partially mycoheterotrophic plant, Pyrola japonica (Ericaceae). The 10th International Mycological Congress. Bangkok (Thailand), August 2014.
  14. ○Matsuda Y, Ichikawa Y, Obase K. Ectomycorrhizal community structure of Pinus thunbergii grown on rocky cliffs in a coastal area. The 10th International Mycological Congress. Bangkok (Thailand), August 2014.
  15. Matsuda Y, Ichikawa Y, Obase K. Contrasting fungal assemblages between ectomycorrhizal roots and extramatrical mycelia of Pinus thunbergii in a coastal rocky cliff. 6th International Symposium on Physiological Processes in Roots of Woody Plants. Nagoya (Japan), September 2014.
  16. Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME. Phylogenetically distinct cryptic species within ectomycorrhizal fungus Cenococcum geophilum sensu lato. 8th International Conference on Mycorrhiza (ICOM8), Flagstaff (USA), August 2015.
  17. Arai H, Obase K, Tamai Y, Yajima T, Miyamoto T. Mycorrhizal fungal communities in a coastal oak (Quercus dentata) forest. 8th International Conference on Mycorrhiza (ICOM8), Flagstaff (USA), August 2015.

Domestic meeting and Symposium

（口頭発表）

  1. ○小長谷啓介、Yoganath Adikari、玉井裕、矢島崇、宮本敏澄．噴火3年を経過した有珠山における木本植物の菌根形成．菌根研究会大会、宇治（京都）、2004年3月．
  2. ○小長谷啓介、玉井裕、矢島崇、宮本敏澄、Yoganath Adikari．有珠山噴出物堆積地における先駆樹種の外生菌根形成．日本林学会北海道支部大会、札幌（北海道）、2004年11月．
  3. ○小長谷啓介、玉井裕、矢島崇、宮本敏澄、Yoganath Adikari．有珠山噴出物堆積地で確認された外生菌根菌．日本森林学会大会、北海道大学（北海道）、2005年3月．
  4. ○小長谷啓介、矢島崇、Yoganath Adikari、玉井裕、宮本敏澄．2000年有珠山噴火後の植生−噴火後５年間の推移−．日本森林学会北海道支部大会、札幌（北海道）、2005年11月．
  5. ○小長谷啓介、Yoganath Adikari、宮本敏澄、玉井裕、矢島崇．有珠山噴火跡地におけるヤナギ類稚樹の外生菌根菌相．日本森林学会大会、東京農業大学（東京）、2006年4月．
  6. ○小長谷啓介、玉井裕、矢島崇、宮本敏澄．有珠山火山性荒廃地で確認された外生菌根菌がドロノキの成長に与える影響．日本森林学会大会、九州大学（福岡）、2007年4月．
  7. ○小長谷啓介、玉井裕、矢島崇．恒温室内における外生菌根菌4種を用いたドロノキ稚樹への菌根合成試験．日本きのこ学会、旭川（北海道）、2007年9月．
  8. ○小長谷啓介．火山性荒廃地に定着した樹木における外生菌根共生の実態とその共生効果．微生物をめぐる生物間相互作用に関する研究集会、土浦（茨城）、2007年10月．
  9. ○Obase K. Mycorrhizal association on devastated areas at volcano Usu, Hokkaido, Japan. The Current Forest Issues and Studies Based on Climatic Change in Several Countries, Chuncheon (Korea), October 2008.
  10. ○小長谷啓介、車柱榮、李相龍、全槿雨．クロマツ（Pinus thunbergii ）海岸林における外生菌根菌群集. −稚樹におけるECM菌種構成の経年変化−．日本海岸林学会岩手大会、陸前高田（岩手）、2008年11月．
  11. ○Obase K. Studies on plant establishment and mycorrhizal symbiosis in disturbed terrestrial locations. Annual meeting of Korean Society of Mycology, Samcheok (Republic of Korea), May 2009.【招待講演】
  12. ○小長谷啓介、松田陽介、伊藤進一郎．ドウダンツツジ属植物の菌根形成．日本菌学会大会、札幌（北海道）、2011年9月．
  13. ○稲葉智美、松田陽介、小長谷啓介、伊藤進一郎．熱ストレスが外生菌根菌Cenococcum geophilum の成長に及ぼす影響．第1回中部森林学会大会、金沢（石川）、2011年10月
  14. ○竹内康介、松田陽介、小長谷啓介、伊藤進一郎．愛知県西ノ浜海岸のクロマツ林から採取した外生菌根菌Cenococcum geophilum の遺伝的構造．第1回中部森林学会大会、金沢（石川）、2011年10月．
  15. ○小長谷啓介、松田陽介、伊藤進一郎．ツツジ科植物サラサドウダンにおけるアーバスキュラー菌根菌の多様性．日本森林学会大会、宇都宮（栃木）、2012年3月．
  16. ○松田陽介、竹内康介、小長谷啓介、伊藤進一郎．日本の海岸クロマツ林におけるCenococcum geophilum の遺伝的多様性．日本森林学会大会、宇都宮（栃木）、2012年3月．
  17. ○小長谷啓介、松田陽介、伊藤進一郎．ツツジ科植物サラサドウダンの根から分離培養された根内内生菌相．日本菌学会大会、岐阜（岐阜）、2012年5月．
  18. ○松田陽介、竹内康介、小長谷啓介、伊藤進一郎．海岸クロマツ林におけるCenococcum geophilum の遺伝的構造．日本菌学会大会、岐阜（岐阜）、2012年5月．
  19. ○Obase K. Mycorrhizal colonization status in Enkianthus campanulatus (Ericaceae). 公開シンポジウム「森林生態系に生きる林床植物の生存戦略−菌根共生系のはたらきを読み解く−」．三重大学（三重）、2012年10月．
  20. ○小長谷啓介、松田陽介．ツツジ科植物の進化過程における菌根菌の変遷に関する一考察．日本森林学会大会、盛岡（岩手）、2013年3月．
  21. ○松田陽介、中野美穂、小長谷啓介、伊藤進一郎．ツツジ科植物イチヤクソウにおける菌根菌の多様性．日本菌学会大会、東京、2013年6月．
  22. ○松田陽介、山川舞、小長谷啓介、谷川東子．塩化ナトリウムがクロマツ-Cenococcum geophilum菌根共生系に及ぼす影響．日本森林学会大会、札幌（北海道）、2015年3月．
  23. ○Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME. Phylogenetic diversity and cryptic species of the ectomycorrhizal fungus Cenococcum geophilum sensu lato.  日本森林学会大会、札幌（北海道）、2015年3月．
  24. ○小長谷啓介．外生菌根菌Cenococcum geophilumの系統学的多様性と隠蔽種について．日本菌学会大会、那覇（沖縄）、2015年5月．【日本菌学会奨励賞受賞講演】
  25. ○荒井洋樹、小長谷啓介、玉井裕、矢島孝、宮本敏澄．石狩海岸林の砂質土壌における菌根菌相．菌根研究会2015年度大会、帯広（北海道）、2015年10月．
  26. ○木下晃彦、山中高史、小長谷啓介、野口亨太郎、古澤仁美．イボセイヨウショウロの子実体発生環境の解明にむけて．日本森林学会大会、鹿児島、2017年3月．

（ポスター発表）

  1. ○小長谷啓介、Yoganath Adikari、宮本敏澄、玉井裕、矢島崇．噴火3年後の有珠山で確認された実生と菌根の形成状態．日本林学会大会、東京大学（東京）、2004年4月．
  2. ○Obase K，Kobayashi T，Miyamoto T，Tamai Y，Yajima T. Inocybe nitidiuscula new to Japan. 日本菌学会大会，千葉，2006年４月．
  3. ○小長谷啓介、玉井裕、矢島崇、宮本敏澄．2000年有珠山火山性荒廃地における植物の菌根形成．日本森林学会北海道支部大会、札幌（北海道）、2006年11月．
  4. ○小長谷啓介、玉井裕、矢島崇．火山性荒廃地で優占していた外生菌根菌が先駆樹種の成長に与える影響．日本緑化工学会大会、京都大学（京都）、2007年９月．
  5. ○Obase K, Cha JY, Lee SY, Lee JK, Chun KW. Ectomycorrhizal fungal community of naturally regenerating Pinus densiflora seedlings on granite slopes formed by the side of the woodland path. Annual meeting of Korean Forest Society, Seoul (Republic of Korea), February 2009.
  6. ○Obase K, Lee SK, Lee JK, Lee SY, Chun KW. Resistance of Cenococcum geophilum and Suillus granulatus isolates to sodium chloride during growth in axenic culture. Annual meeting of Korean Forest Society, Sujeong (Republic of Korea), March 2010.
  7. ○稲葉智美、松田陽介、小長谷啓介、伊藤進一郎．西ノ浜海岸のクロマツ菌根に由来するCenococcum geophilum の異なる温度条件下における菌糸伸長．日本森林学会大会、宇都宮（栃木）、2012年3月．
  8. ○稲葉智美、松田陽介、小長谷啓介、伊藤進一郎．海岸のクロマツ菌根に由来するCenococcum geophilum の異なる温度条件下における菌糸伸長．日本森林学会大会、盛岡（岩手）、2013年3月．
  9. ○松田陽介、山川舞、稲葉智美、小長谷啓介、伊藤進一郎．異なる塩化ナトリウム濃度が外生菌根菌Cenococcum geophilum の菌糸成長に及ぼす影響
  10. ○小長谷啓介、松田陽介．ドウダンツツジ挿し木へのエリコイド菌根菌様菌類の接種試験．日本菌学会大会、東京、2013年6月．
  11. ○荒井洋樹、玉井裕、小長谷啓介、矢島崇、宮本敏澄．北海道石狩海岸林における外生菌根菌相．日本菌学会大会、東京、2013年6月.
  12. ○Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME. Culturable fungal biota growing on Cenococcum sclerotia in forest soil. Annual meeting of Mycological Society of America, East Lansing (USA), June 2014. 
  13. ○稲葉智美、松田陽介、小長谷啓介、伊藤進一郎．高温条件下におけるCenococcum geophilumとショウロの菌糸伸長．日本菌学会大会、小松（石川）、2014年6月.
  14. ○Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME. Revisiting the genetic diversity of the ectomycorrhizal fungus Cenococcum geophilum: from regional to intercontinental scale. 日本生態学会大会、鹿児島、2015年3月．
  15. ○小長谷啓介、Douhan GW、松田陽介、Smith ME. 外生菌根菌Cenococcum geophilumの菌核から分離培養されたCladophialophora属の2新種について．日本菌学会大会、那覇（沖縄）、2015年5月．
  16. ○Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME. Cenococcum geophilumの遺伝的多様性解析における分離源の影響．菌根研究会2015年度大会、帯広（北海道）、2015年10月．
  17. ○Obase K, Douhan GW, Matsuda Y, Smith ME. Genotypic diversity of the ectomycorrhizal fungus Cenococcum geophilum at a soil core scale. 日本森林学会大会、藤沢（神奈川）、2016年3月．
  18. 木下晃彦、○小長谷啓介、阿部淳一、山中高史．コナラ属樹種およびアカマツに形成されたイボセイヨウショウロの外生菌根．日本菌学会大会、京都、2016年9月.
  19. ○古澤仁美、山中高史、野口亨太郎、木下晃彦、小長谷啓介、阿部淳一、．日本国内における黒トリュフ発生地の土壌環境条件．日本菌学会大会、京都、2016年9月.
  20. ○小長谷啓介．キツネタケの菌根から分離培養されたバクテリア．日本森林学会大会、鹿児島、2017年3月．
  21. ○山中高史、小長谷啓介、尾崎研一．保残伐施業前の北海道トドマツ人工林で確認された外生菌根．日本森林学会大会、鹿児島、2017年3月．

Copyright Keisuke OBASE